Un test portable discerne le variant Alpha du SARS-CoV-2
Le test COVID-19 mis au point par des chercheurs de l’Université de l’Illinois à Urbana-Champaign peut désormais détecter et différencier le variant Alpha du SARS-CoV-2 des souches précédentes dans des échantillons de salive.
Un nouveau test utilisant des échantillons de salive
Ce nouveau test s’appuie sur les développements précédents du groupe, qui permettaient de contourner le laboratoire – d’abord avec des écouvillons nasopharyngés, puis avec des échantillons de salive. Le processus d’amplification et de test au point de service, appelé LAMP, est plus efficace que la PCR car il ne nécessite pas de machines à cycles thermiques coûteuses.
Les chercheurs ont précisé que ce test ne nécessite pas d’étapes d’extraction et de purification de l’ARN, comme le test salivaire. « Notre étude montre qu’il est possible de tester les variants de la même souche de coronavirus dans un seul test au point de service qui prend 30 minutes à l’aide d’un appareil portable », a déclaré Bashir.
Il est évolutif
« Ce nouveau test est évolutif pour s’adapter aux futures pandémies, COVID-19 ou autres, et pourrait être utilisé à domicile ou dans d’autres contextes. » Le processus mis à jour tire parti d’un phénomène génétique appelé échec de la cible du gène S – qui est présent dans le variant Alpha mais pas dans les premières souches du SARS-CoV-2 – pour différencier les deux variants Alpha, ont indiqué les chercheurs.
« Le nouveau variant Omicron présente également un défaut de ciblage du gène S et pourrait être testé en adaptant l’approche développée dans cette étude », a déclaré Valera.
Au cours du nouveau processus de test, des amorces génétiques spécialement sélectionnées sont placées sur des cartouches fabriquées de manière additive et séchées avant d’ajouter les échantillons des patients. Les amorces choisies sont fixées contre le gène S et sont spécifiques pour détecter l’échec de la cible du gène S contre la délétion 69-70 dans le variant Alpha, rapporte cette étude.
Une étude confirme son efficacité
Cette étude a confirmé l’efficacité de ce dispositif en testant 38 échantillons de salive clinique, dont 20 échantillons positifs pour le variant Alpha.
Cette recherche a été publiée dans Lab on a Chip.
Source : University of Illinois Urbana-Champaign
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