Un test pour détecter tous les variants du COVID-19
Des chercheurs de l’université de Caroline du Nord à Chapel Hill et de l’université de Californie à San Diego ont tiré parti de l’appétence pour le sucre du virus en concevant une bandelette de test pour le COVID-19 enrobée de sucre qui s’est avérée efficace pour détecter tous les variants connus du coronavirus, y compris le Delta.
Le test GlycoGrip détecte les variants
Dans les prochaines semaines, les chercheurs détermineront si ce test qui est connu sous le nom de GlycoGrip peut également détecter les infections causées par le variant Omicron, a déclaré Ronit Freeman, chercheur à l’université de Caroline.
« Nous avons retourné la situation du virus en utilisant la même couche de sucre que celle à laquelle il se lie pour infecter les cellules – pour le détecter dans notre capteur », a déclaré Freeman. « Nous sommes convaincus que GlycoGrip détectera les futurs variants tout aussi facilement », a ajouté Mme Freeman.
Ce test s’inspire de la biologie naturelle des cellules épithéliales – celles qui sont ciblées et infiltrées par le SARS-CoV-2. Ces cellules sont recouvertes d’une matrice dense de sucres appelée glycocalyx, et c’est ce filet de sucre que le virus exploite pour provoquer l’infection.
Une gouttelette de salive
Le concept est intuitif : une gouttelette de biofluide contenant le virus, comme la salive, est placée à une extrémité de la bande et s’écoule le long de la surface. Lorsque le fluide atteint un patch enrobé de sucre, le virus ne peut s’empêcher de se laisser aller à sa gourmandise et se retrouve piégé sur cette zone spécifique. Cette capture est ensuite signalée par des anticorps traités avec des nanoparticules d’or, qui produisent une couleur visuelle indiquant l’infection.
« Nous avons puisé dans la nature pour réimaginer les diagnostics viraux », a déclaré M. Freeman, co-auteur de l’article. Pour mieux comprendre comment ces polymères de sucre se lient au virus, Freeman s’est associé à Rommie Amaro, professeur de chimie et de biochimie à l’université de Californie San Diego et co-auteur correspondant de cette étude.
Amaro et son équipe ont mis au point des simulations à forte intensité de calcul qui ont permis d’expliquer les mécanismes qui sous-tendent comment et pourquoi les sucres ancrés dans les cellules se lient aux pics viraux.
« En utilisant des vues au niveau atomique de la protéine S, nous avons pu identifier les sites de liaison-clés pour les polymères de sucre du glycocalyx et découvrir comment ces sucres s’adaptent aux différentes conformations S », a déclaré Amaro. « C’est passionnant, nous avons essentiellement révélé un autre secret de la façon dont la protéine S se lie aux cellules pour faciliter l’infection ».
Pour un large éventail de virus
Un brevet a été déposé pour cette nouvelle technologie, et au-delà de la pandémie actuelle, l’équipe envisage un avenir dans lequel GlycoGrip pourra offrir un test bon marché et fiable pour un large éventail de virus.
Cette recherche a été publiée dans ACS Central Science.
Source : University of North Carolina at Chapel Hill
Crédit photo : StockPhotoSecrets